Проблема в том, что помимо метода ПЦР, который реплицирует выделенное из аналитической пробы пациента часть РНК вируса (если он есть в базе данных), чтобы доказать, что симптомы были вываны именно этим патогеном, нужно пройти 4 критерия Коха:
1.Микроорганизм постоянно встречается в организме больных людей (или животных) и отсутствует у здоровых;
2.Микроорганизм должен быть изолирован от больного человека (или животного) и его штамм должен быть выращен в чистой культуре;
3.При заражении чистой культурой микроорганизма здоровый человек (или животное) заболевает;
4.Микроорганизм должен быть повторно изолирован от экспериментально заражённого человека (или животного).
Говоря простым языком, можно определить наличие некого кусочка РНК, который непонятно на каком основании будет приписан к определнному вирусу. Чтобы сказать, что этот кусочек нити РНК именно его - нужно знать целый его РНК априори - то есть изучить его геном. Но чтобы это сделать - нужно пройти второй критерий Коха. То есть изолировать чистый вирус на культуре.
В ситуации с 2019-nCoV странно то, что нигде нет нформации от том, были ли пройдены критерии Коха и когда. Потому что если нет - то наличия кусочка РНК вируса в крови амплифицированное методом ПЦР (через обратную транскриптазу и комплиментарное ДНК) не является доказательством того, что симптомы у пациента (кашель, насморк) вызваны именно патагеном с этим геномом. То есть человек может болеть любым ОРЗ иметь в крови куски РНК нескольких разных вирусов. Нужно доказать, что симптомы вызваны одним из них, а не другими, а на это требуется долгое время. Когда они это успели сделать, кого заразили эксперемнтально и как выделили чистую культуру 2019-nCoV, чтобы секвенировать весь его геном? Ведь офицально - вирус совершенно новый и ранее не встречвшийся.
Без выделения чистого вируса невозможно расшифровать его геном, а без расшифровки его генома (всей последовательности нуклеотидов цепочки РНК) невозможно определение вируса в пробе пациента методом ПЦР.
Я пытaлся найти об этом информацию, но нашел
странную заметочку о приключении зараженного китайца в РФ, в кoторой была такая фраза:
«Мы разработали эти наборы очень оперативно: 10 января появилась первая нуклеотидная последовательность нового коронавируса, и уже менее чем за неделю мы разработали два набора, — говорит она. — Они отличаются: один непосредственно выявляет новый коронавирус, второй позволяет выявлять как новый коронавирус, так и вирус тяжелого острого респираторного синдрома, более нам известный как вирус атипичной пневмонии, который вызвал заболевание в 2000-х годах».
В США методику для выявления коронавируса разработали Центры по контролю и профилактике заболеваний. Первым шагом стало определение генома вируса. Часть его областей удалось выявить благодаря сходству с другими коронавирусами.
Так как геном коронавируса состоит из РНК, а не ДНК, исследователи использовали фермент обратную транскриптазу, которая создает копию ДНК на основе РНК (транскрипция — это синтез РНК с использованием ДНК в качестве матрицы, здесь же применялся обратный процесс). Сам вирус изолировать не пришлось — фрагменты ДНК собственных клеток пациента, бактерий и т. п. удалось отсеять с помощью соответствующего программного обеспечения. К этому времени китайские власти тоже расшифровали геном вируса и опубликовали данные.
После этого все стало ясно - никто второй критерий Коха не проходил. Геном 2019-nCoV просто придумали в какой-то компьютерной симуляции по сходству с другими короновирусами. А потом разослали во все лаборатории с ПЦР. И там делают реакцию на...виртуальную РНК, реалный кусок которой принадлежит совершенно другому вирусу, возможно совершенно безвредному и статистически присутствующему у нескольких процентов населения, так как короновирусы известны давно и циркулируют среди людей. При этом сами симптомы может давать грипп, РНК которого не реплицируют, так как из ВОЗ не было на это указания.
